Linux下的环境变量分为系统级别和用户级别。系统级别的会影响所有系统用户，而用户级别的只会影响某个单独用户。这种分级别的设置是很好的一种系统架构，不确定windows下是不是也有类似的机制。
env显示系统级别环境变量
set显示用户级别环境变量
set 变量名称，设置用户级别环境变量
set PATH=/usr/local/jre-1.5.6/bin:$PATH
unset 变量名称，清除用户级别环境变量
readonly 变量名称，设置用户级别环境变量为只读
上述的设置方法，只针对特定的session，如果退出或者打开新的terminel后用户级别环境变量将不会有效。
在debian下，可以修改用户HOME目录下的.bashrc确保永久有效。
root用户会有.bashrc和.profile，我觉得效果应该一样。
root也可以修改/etc/profile修改系统级别环境变量。
