首先声明，我是一个中立者，LINUX与WINDOWS我都在用，在这里想讲一些公道话。
首先，LINUX在桌面应用上对绝大部份电脑用户，是不可能替代WINDOWS的，因为目前LINUX里还是有很多WINDOWS下的功能无法实现，比如我的索爱Z520手机，在WIN下有索爱套件软件可以让它与PC通信，而在LINUX下我做不到，我要在淘宝上买卖东西，网上银行划帐，在LINUX做不到。所以，那些说可以用LINUX完全替代WIN的人只能是针对做特定工作的或者说特定需求的用户，比如平时主要用来编程，或做做WORD文档等。
这一点归根结底来说主要原因是这几点，LINUX下软件还是不够丰富，WIN下很多优秀的软件在LINUX还是没有替代品的，微软的霸主地位使得它可以主导基于IE的很多技术规范，而这些技术规范是只能基于IE的，以及WIN的主导地位使得许多软件只针对WIN开发。改变这一切的唯一方法就是提高LINUX桌面用户的用量，但这是需要很长时间的，所以LINUX在可预见的未来是没有实力来与WIN一较高低的。
LINUX兼容性差，经常有这样的情况，同一个LINUX，在一台机子上能装，在另一台机子上就装就出问题了，相信这种情况大家经常见，至少是经常听说。而WINDOWS几乎可以在所有的PC机上正常安装使用，本来LINUX就是小众系统，就算一个新手对LINUX充满热情，但正巧他的机子与他选用的LINUX存在兼容性问题，无法在他的机子上正常安装或使用，他还有会热情投入LINUX，或许其它某款适合他，但他不可能把所有常见LINUX一个个都装上看看。我的机子装ML与HIWEED等几款LINUX都没事，可是装EVEREST却经常死机，在他们论坛发贴问，结果被告知“这说明你的机子不适合EVEREST”，一个系统应该去适应机子，而不是让机子适应系统。科技以人为本，大家不要笑那些傻瓜式的新手，操作系统就应该简单得让傻瓜都能操作，你不能要求每个用户都成LINUX高手，我们只想用LINUX，而不是玩LINUX，否则LINUX永远不可能成为主流系统。
软件稳定性差，LINUX下许多软件总会出些莫名其妙的小毛病，这种情况不用我再细述了吧。
软件安装烦琐，虽然各款LINUX在软件的安装的易用性上都大作文章，但比起WINDOWS与MAC OS来讲还是复杂得多，对于新手几乎是一个头两个大的事，首先你不懂命令行是不行的，而且就算你懂还是会经常有很多软件装不上，安装过程中报错，这类情况很多朋友都遇到吧，而且还有BIN格式的，RPM格式的，DEB格式的，还有解压后可直接运行的，还有在命令行下MAKE的，什么时候LINUX能真像WINDOWS下安装软件这么简单将是一大进步。直接双击，下一步下一步就可以安装好一个软件。
很多好的LINUX版本如HIWEED，MAGICLINUX都是社区版，几个技术人员利用业余时间来搞，这样的系统结果可能都很短命，因为技术人员也要工作赚钱吃饭，不可能把大量的时间都花在开发一个赚不到钱的LINUX系统上。而很多有实力的LINUX公司开发出的都很烂，特别是国内的某些LINUX公司，在这我就不细讲了。
LINUX太散，缺乏统一，因为LINUX是开源的，这是无法避免的，但WIN与MAC OS的封闭式的系统也有他们的好处，由于统一开发，其系统内部各部件及软件音的配合度更高，界面上也更统一，比如MAC OS为什么那么漂亮，不仅仅是因为他的系统漂亮，它上面运行的软件在开发上都要追寻MAC的简洁大方的风格，这才使他的系统及其软件看起来就像是一个整体，这些在其它系统上仅靠更改系统主题是永远做不到的，所以，无论LINUX还是WINDOWS美化模仿MAC，永远只能模仿到它的壳而模仿不到它的内在。
但LINUX发展还是很快的，至少与WINDOWS相比，它的发展速度几乎是惊人的，几年前刚接触的LINUX与现在的LINUX几乎一个天上一个地下。但是桌面之路还是有很漫长的路要走，希望LINUX能一路走好。
