Debian GNU/Linux 依照 文件系统层次标准 (Filesystem Hierarchy Standard) 安排文件以及文件命名。该标准让用户和软件程序预知文件以及目录的位置。根目录只是简单表现为 /。在根层次，所有的 Debian 系统包括这些目录：
目录 内容
bin 基本命令执行文件
boot boot loader 的静态链接文件
dev 设备文件
etc 主机特定的系统配置
home 用户目录
lib 基本共享库以及内核模块
media 用于移动介质的挂载点
mnt 用于临时挂载文件系统
proc 系统信息的虚拟目录(2.4 和 2.6 内核)
root root 用户的目录
sbin 基本系统命令执行文件
sys 系统信息的虚拟目录(2.6 内核)
tmp 临时文件
usr 第二级目录
var 不断变化的数据
srv 系统提供的用于 service 的数据
opt 附加的应用程序软件包
下面列出关于目录和分区的重要考虑。要注意磁盘的使用随系统配置和特定用途有很大变化。这里所推荐的是通用指引，提供如何分区的起点。
根分区 / 必须总是物理地包含 /etc、/bin、/sbin、/lib 和 /dev，否则您将不能启动系统。典型的根分区需要 150-250MB 大小空间。
/usr：包含所有的用户程序(/usr/bin)，库文件(/usr/lib)，文档(/usr/share/doc)，等等。这是文件系统中耗费空间最多的部分。您需要提供至少 500MB 磁盘空间。总容量会依据您要安装的软件包数量和类型增长。宽松的工作站或服务器安装应该需要 4-6GB。
/var：所有的可变数据，如新闻组文章、电子邮件、网站、数据库、软件包系统的缓存等等，将被放入这个目录。这个目录的大小取决于您计算机的用途，但是对大多数人来说，将主要用于软件包系统的管理工具。如果您准备一次性地做一个全面的安装，包含 Debian 提供的所有程序，/var 下面 2 或 3GB 的空间应该够用。如果您准备逐个安装(也就是说，安装服务程序和工具，然后是文本处理工具，然后是 X，...)，您准备 300-500 MB 就行。要是硬盘空间很紧张，并且不准备做主版本的系统升级，可以为其准备 30 或 40MB 大小。
/tmp: 程序创建的临时数据大都存到这个目录。通常 40-100 MB 应该足够。一些应用程序 -- 包括归档处理程序、CD/DVD 制作工具和多媒体软件 -- 可能会使用 /tmp 临时保存映像文件。如果要使用这些程序，应该相应地调整 /tmp 目录的大小。
/home：每个用户将放置他的私有数据到这个目录的子目录下。其大小取决 于将有多少用户使用系统，以及有什么样文件放在他们的目录下。根据规划的用途，应该为每个用户准备 100MB 空间，不过应该按您的需求调整。假如您在 home 目录下计划保存大量的多媒体文件(图片、MP3、电影)，该预备更多的空间。
