用PITA算法做靶标预测的时候，要用到ViennaRNA包做结构的折叠，这个包是被修改过的，原来的包在我机子上是可以装的。但是这个修改过的包编译不通过。很奇怪的错误，不知道怎么改。
好在它有两个版本，64位和32位的。我弄到大型机上去编译32位的，也是出错，不过是命名空间的问题，我改两个头文件就可以通过了。最近又要算。那个大型机最近被搬走了。只能本机上做。
所以折腾了一下，在64位的系统里编译32位的程序。
CPU: AMD Athlon(tm) 64 X2 Dual Core Processor 3800+
OS: Ubuntu 7.10/Linux 2.6.20-15-server #2 SMP Sun Apr 15 06:22:36 UTC 2007 x86_64 GNU/Linux
GCC: gcc (GCC) 4.1.2 (Ubuntu 4.1.2-0ubuntu4)
首先需要安装32位的兼容库
apt-get install ia32-libs libc6-dev-i386 linux32
1.用linux32命令在configure时改一下CHOST，设置一下编译环境
$ linux32 ./configure
#系统类型将变为：i686-pc-linux-gnu
#而不是x86_64-unknown-linux-gnu
2.设定GCC的参数
export CFLAGS="-m32 -04 -march=i386 -mtune=i386"
#最关键是-m32
-m32, -m64
Generate code for a 32-bit or 64-bit environment. The 32-bit environment sets int, long and pointer to 32 bits and generates code that runs on any i386 system. The 64-bit environment sets int to 32 bits and long and pointer to 64 bits and generates code for AMD's x86-64 architecture.
3.编译
make
4.安装
sudo make install
最终是成功地安装了。破PC机又得跑好多天了。
