可能是，数据库连接没有关闭，读取文件没有关闭流。
解决如下：
vi /etc/sysctl.conf
编辑文件，加入以下内容：
net.ipv4.tcp_syncookies = 1 表示开启SYN Cookies。当出现SYN等待队列溢出时，启用cookies来处理，可防范少量SYN攻击，默认为0，表示关闭；
net.ipv4.tcp_tw_reuse = 1 表示开启重用。允许将TIME-WAIT sockets重新用于新的TCP连接，默认为0，表示关闭；
net.ipv4.tcp_tw_recycle = 1 表示开启TCP连接中TIME-WAIT sockets的快速回收，默认为0，表示关闭。
net.ipv4.tcp_fin_timeout 修改系統默认的 TIMEOUT 时间
修改之后，再用。
然后执行 /sbin/sysctl -p 让参数生效。
netstat -ae|grep MySQL 发现大量的TIME_WAIT 已不存在，程序代码中没有使用mysql.colse()，才导致大量的mysql TIME_WAIT。
如果修改错了，还原。