红联Linux门户
Linux帮助

windows与ubuntu下R安装xlsx包经验谈

发布时间:2017-03-11 11:22:43来源:blog.sciencenet.cn/u/shixiangw作者:王诗翔
xlsx包的安装需要依赖rJava包,而rJava包需要java运行环境。说起来容易,做起来比较繁琐,也经常出问题,昨天成功在windows下和ubuntu下安装xlsx包,因此写写经验之谈。
首先java的选择,版本到官网下。但是不要下JRE,要下JDK。关于两者的区别,网上有许多介绍,例如,JDK,JRE,JVM区别与联系[附1],简单地说JDK更全更新一些。
 
windows下安装
windows下安装相对来说是比较容易的,下载好JDK后,傻瓜式安装便好了,你可以选择默认的目录路径进行安装,也可以根据你自己的想法进行安装。但是路径需要记住(能找到)。
然后设置JDK环境变量,方法参见JDK环境变量配置[附2],或者其他相关经验、博客,这个网上一堆。记得验证一下是否安装成功,在cmd命令符下输入JAVA、JAVAC都有输出表示已经成功了。
打开R或者Rstudio,输入安装包命令
install.packages("xlsx",dependencies=TRUE)
因为windows下,变量检索的机制比较好,R能够顺利知道java在哪里,不出其他意外,是会成功的。
 
Ubuntu下安装
过程大致跟windows一样,但更复杂繁琐。
可以直接在终端下用命令安装JRE(JDK好像也可以,不过我忘了...)
sudo apt-get install default-jre
也可以参考网上教程,下载并安装,例如Ubuntu下JDK安装详解(http://www.linuxdiyf.com/linux/25859.html)。但是过程中注意,在将jdk解压到/usr/lib/jvm下后,将其名字改为default-java,使用命令
sudo mv jdkXXX(JDK文件名字) default-java
然后环境变量中目录也改成相应的default-java(好像ubuntu下R只识别default-java目录,不知道为啥)
export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/default-java
export JRE_HOME=${JAVA_HOME}/jre
export CLASSPATH=.:${JAVA_HOME}/lib:${JRE_HOME}/lib
export PATH=${JAVA_HOME}/bin:$PATH
然后在终端下输入命令,链接R与java
R CMD javareconf
然后在R或者Rstudio中安装xlsx包
install.packages("xlsx",dependencies=TRUE)
如果安装有问题,可以通过终端命令
sudo R
进入R环境,安装相应包,能够看到更多的报错信息。然后调试。
Ubuntu下的安装问题,主要是R很难识别Java在哪里(找不到),即使java已经安装好了。把握这一点,出错找这方面的原因,就能解决了。关键是安装路径以及
R CMD javareconf
 
附1:
windows与ubuntu下R安装xlsx包经验谈
 
附2:
windows与ubuntu下R安装xlsx包经验谈
 
本文永久更新地址:http://www.linuxdiyf.com/linux/29095.html