ubuntu 16.10下的gnome shell不支持自然滚动，从系统设置了选了自然滚动也白搭。
下面的办法可以帮你找回来自然滚动，只要两行命令就ok了。
$ synclient VertScrollDelta=-91
$ synclient HorizScrollDelta=-91
设置gnome shell自然滚动就这么简单，亲测有效。其它Ubuntu版本参考：在Ubuntu中如何启用Mac OS X中一样自然滚动（http://www.linuxdiyf.com/linux/5255.html）