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Ubuntu下安装imagej和Fiji

发布时间:2016-11-20 09:24:34来源:linux网站作者:帅气的弟八哥
安装ImageJ
方法一
sudo apt-get install imagej
whereis imagej
imagej -version
方法二
下载 Linux版本的 imagej(https://imagej.nih.gov/ij/download.html)
安装 Instructions(https://imagej.nih.gov/ij/docs/install/linux.html)
cd /home
mkdir imagej
cp ij150-linux64-java8.zip /home/imagej
unzip ij150-linux64-java8.zip
建立软连接,可以在终端直接打开imagej
ln -s /home/imagej/imagej-linux64 /usr/bin/imagej
whereis imagej
imagej  //  可直接打开imagej
 
安装Fiji
因为Ubuntu中安装的imagej中缺少很多的Plugin,导致经常出现如下错误
Ubuntu下安装imagej和Fiji
而Fiji自带很多的Plugin。
下载 Fiji(http://fiji.sc/#download)
cd /home
mkdir Fiji
cp fiji-linux64.zip /home/Fiji/
unzip fiji-linux64.zip
建立软连接,可以在终端直接打开imagej
ln -s /home/Fiji/imagej-linux64 /usr/bin/imagej
whereis imagej
imagej //可直接打开 Fiji,(Fiji is just ImageJ)
 
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