方法一：
源码包安装，也就是手动安装。
首先把要安装的包下载到自己的电脑里，然后直接在命令行输入：
R CMD INSTALL -l dir_of_your_library dir_of_your_package.
e.g. R CMD INSTALL -l /home/ltm/R/R-3.0.2/library/home/ltm/R/R_package/gplots.
这里需要注意的就是输入命令实在bash命令行输入，而不是进入到R的命令行。
如果依赖除了问题，会有错误提示的：
e.g.ERROR: dependencies 'gtools', 'gdata' are not available forpackage 'gplots'.
这时候，先把'gtools', 'gdata' 安装上，再去安装 'gplots'就可以了。
如果安装成功了会提示：
* DONE (gplots)
注意:R包下载后，要先解压。
方法二：
从镜像站点直接安装，也就是自动安装。
这个比较简单了，不用去下载，这里输入命令与第一种方法不同的是，命令是在R的命令行中输入的，也就是说要先进入R，然后输入：
>install.packages("IDPmisc",repos="http://172.30.0.75/cran/",lib="/ifs1/ST_POP/USER/someone/bin/install_SW/lib64/R/library")
然后就可以安装了，包之间的依赖问题，应该可以自己解决了,dependencies=TRUE。