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在Red Hat 5(AS 5)上配置多节点MPI互联

发布时间:2015-02-24 14:59:24来源:linux网站作者:jugeombu

在各节点上分别执行:

第一步,以root账户登录系统

安装mpich2-1.1

第二步,$ vim /etc/sysconfig/network

# 将文件中的“localhost.localdomain”修改为

# “{自定义主机名}.localdomain”

# 然后保存退出

第三步,$ vim /etc/hosts

# 将文件中的“127.0.0.1”(即本机回路地址)修改为

# “{本机当前IP地址} {自定义主机名}.localdomain {自定义主机名} ”

# 注意,此处的“自定义主机名”必须与第二步修改的相同

# 然后保存退出

$ reboot # 重启系统,使修改生效

第四步,以root账户登录系统

$ service iptables stop

# 关闭本机的防火墙

第五步,在主控节点上

$ mpd & # 启动后台守护进程

$ mpdtrace -l # 查看并记录端口号

在其他各节点上

$ mpd -h {主控节点当前IP地址} -p {刚才记录的主控节点端口号} &

# 启动后台守护进程,并使该进程与主控节点的守护进程相联

第六步,$ mpdtrace -l # 显示当前相联的各节点的 主机名_端口号(IP地址)

如果第五步顺利执行的话,各节点就通过MPI成功互联了。

PS:过程中参考了mpich2-1.1的userguide。

精确控制各节点进程数的指令为:

$ mpiexec -l -n {进程数1} -host {节点1的IP地址} {程序1} : -n {进程数2} -host {节点2的IP地址} {程序2} : ……

从该指令可以看出,MPI允许各节点运行不同的程序。

第一步,以普通用户账户登录系统

到MPI的官方网站上下载mpich2-1.1.tar.gz

官网地址乃google所得

下载完毕后,将该压缩包放在根目录底下

$ tar -xzvf mpich2-1.1.tar.gz

将该压缩包直接解压到根目录底下

第二步,$ su #登录root账户

$ cd /mpich2-1.1

$ ./configure --prefix=/usr/local/mpich2-1.1

# --prefix= 后面乃mpich2-1.1的安装路径

$ make

$ make install

$ exit #退出root账户

第三步,$ cd /home/you # you 乃普通用户账户名

$ vim .bash_profile

在该文件的最后追加如下两行

export PATH=/usr/local/mpich2-1.1/bin:$PATH

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/mpich2-1.1:$LD_LIBRARY_PATH

之后保存退出

$ source .bash_profile

$ touch .mpd.conf

$ echo "secretword=..." > .mpd.conf

# ... 乃用户随意设置的密码,最好不同于普通用户账户的密码

$ chmod 600 .mpd.conf

第四步,测试MPI环境是否已经搭建成功

$ mpd & #启动后台守护进程

$ mpdtrace -l #显示守护进程的主机名和端口号

$ mpdallexit #杀死守护进程

如果第四步顺利执行,就表明普通用户账户的MPI环境已经成功搭建起来了。之后要是将开始时解压缩得到的文件夹删除也没有关系。